Cuerpo de Técnicos Superiores de Salud Pública, Especialidad de Bioinformática — Consejería de Economía, Hacienda y Empleo

TEMARIO GENERAL

1. 1. La Constitución Española de 1978: Características y estructura. Derechos fundamentales y libertades públicas: Su garantía y suspensión.
2. 2. La distribución de competencias entre las Administraciones Públicas. Competencias exclusivas, compartidas, concurrentes, de desarrollo y ejecución. La interpretación del Tribunal Constitucional. Principio constitucional de autonomía local.
3. 3. La Comunidad de Madrid (I): El Estatuto de Autonomía: estructura. Las competencias de la Comunidad de Madrid: Potestad legislativa, potestad reglamentaria y función ejecutiva.
4. 4. La Comunidad de Madrid (II): La Asamblea Legislativa: composición, funciones y potestades. El Presidente de la Comunidad y el Gobierno: composición, designación y remoción. Funciones y potestades
5. 5. La Comunidad de Madrid (III): La Administración Autonómica: organización y estructura básica de las Consejerías. La Administración Institucional de la Comunidad de Madrid: Tipología y regulación
6. 6. La organización de los servicios de información y atención al ciudadano de la Comunidad de Madrid. Sistema de sugerencias, quejas y reclamaciones. El tratamiento del acceso a la información pública en la Ley 19/2013, de 9 de diciembre, de Transparencia, Acceso a la Información Pública y Buen Gobierno. Especial referencia a la Comunidad de Madrid: Ley 10/2019, de 10 de abril, de Transparencia y de Participación de la Comunidad de Madrid.
7. 7. Las Instituciones de la Unión Europea. El Consejo Europeo, el Consejo, la Comisión Europea, el Parlamento Europeo, el Tribunal de Justicia y Tribunal de Cuentas de la Unión Europea y otros Órganos.
8. 8. Las fuentes del Derecho Comunitario Europeo. Las relaciones entre el Derecho comunitario y el ordenamiento jurídico de los Estados miembros. Las funciones de los Estados miembros en la aplicación del Derecho Comunitario. La participación de las Comunidades Autónomas en la aplicación del Derecho Comunitario.
9. 9. El principio de legalidad y la jerarquía normativa. Las fuentes del Derecho Administrativo. La Ley. Disposiciones del ejecutivo con fuerza de ley. El Reglamento.
10. 10. La Hacienda Pública de la Comunidad de Madrid. La Ley de Hacienda de la Comunidad de Madrid: Estructura, contenido y principios generales.
11. 11. El Presupuesto de la Comunidad de Madrid: concepto y regulación jurídica. El ciclo presupuestario. Elaboración, examen, enmienda y aprobación del presupuesto.
12. 12. La Ley 39/2015, de 1 de octubre, del Procedimiento Administrativo Común de las Administraciones Públicas. La Ley 40/2015, de 1 de octubre, de Régimen Jurídico del Sector Público.
13. 13. La responsabilidad patrimonial de la Administración. El régimen jurídico en el sistema español. Responsabilidad de autoridades y funcionarios. Responsabilidad de la Administración por actos de sus concesionarios y contratistas.
14. 14. Los contratos administrativos. Clases. El expediente de contratación y su tramitación. Procedimientos y criterios de adjudicación. Ejecución y modificación de los contratos. Pago del precio. Extinción de los contratos: Cumplimiento y resolución.
15. 15. El texto refundido de la Ley del Estatuto Básico del Empleado Público. Adquisición y pérdida de la condición de funcionario. Situaciones administrativas. Derechos, deberes e incompatibilidades. Régimen disciplinario. Especial referencia a la Ley de la Función Pública de la Comunidad de Madrid. Decreto por el que se regula la modalidad de prestación de servicios en régimen de teletrabajo en la Administración de la Comunidad de Madrid. La Ley de la Función Pública de la Comunidad de Madrid.
16. 16. El principio de igualdad entre mujeres y hombres. La tutela contra la discriminación. El marco normativo de la igualdad de género, la protección integral contra la violencia de género y no discriminación de las personas LGTBI. Especial referencia a la Comunidad de Madrid

TEMARIO ESPECÍFICO

1. 1. Epidemiología: concepto. Objetivos. Usos. Estrategias. Causalidad en epidemiología
2. 2. Metodología de investigación. Aspectos éticos de la investigación epidemiológica. Comité de Ética. Ley de Protección de datos. Consentimientos informados.
3. 3. Vigilancia epidemiológica. Concepto, actividades y aplicaciones. Sistemas de vigilancia epidemiológica en España y en la Comunidad de Madrid. Normativa legal vigente.
4. 4. Microbiología Clínica y Salud Pública. Microbiología Clínica en un Laboratorio de Salud Pública. Concepto, características especiales y focos de actividad.
5. 5. Redes de laboratorio de Vigilancia Microbiología. Estructura, niveles y ejemplos.
6. 6. Bioestadística. Inferencia estadística y visualización aplicada al análisis de datos biológicos.
7. 7. Regresión, modelos y métodos. Análisis multivariante.
8. 8. Clasificación y características de los estudios epidemiológicos. Instrumentos de medida. Indicadores de morbilidad y mortalidad.
9. 9. Estudio de brotes epidémicos y actuaciones frente a la sospecha de un brote.
10. 10. Vigilancia epidemiológica. Conceptos generales. Sistemas de Vigilancia Epidemiológica. Normativa.
11. 11. Red Estatal de Vigilancia Epidemiológica.
12. 12. Principales Enfermedades de Declaración Obligatoria. Importancia en la Salud Pública.
13. 13. Laboratorios de análisis de aguas, legionela y alimentos. Laboratorios de referencia. Organismos de acreditación. Sistemas de garantía de calidad.
14. 14. Calidad en el Laboratorio. Norma EN ISO/IEC 17025 y Norma UNE-EN ISO 15189.

FUNDAMENTOS DE MICROBIOLOGÍA Y GENÉTICA MOLECULAR

1. 15. Estructura y organización celular de las bacterias. Componentes celulares.
2. 16. Replicación del ADN bacteriano y mecanismos de regulación genética.
3. 17. Elementos genéticos extracromosómicos: plásmidos, transposones y otros elementos móviles. Transferencia horizontal de material genético en bacterias.
4. 18. Bases moleculares de la resistencia a antimicrobianos. Mecanismos de adquisición y diseminación.
5. 19. Morfología, clasificación y estructura de los virus.
6. 20. Mecanismos de replicación de virus de ADN y ARN.
7. 21. Métodos de cultivo bacteriano y fundamentos de microbiología clásica. Tipificación bacteriana convencional: tinción de Gram, pruebas bioquímicas y serotipado.
8. 22. S. pneumoniae. Características y mecanismos de virulencia.
9. 23. Otros microorganismos Gram+ de importancia en Salud Pública. Staphylococcus aureus, Corynebacterium diphtheriae y Enterococcus faecium
10. 24. Enterobacterias productoras de carbapenemasas.
11. 25. Otros microorganismos Gram- de importancia en Salud Pública. Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanii y género Bordetella
12. 26. Enfermedades relacionadas con el Sistema Nervioso Central. Neisseria meningitidis, Streptoccocus pneumoniae y Haemophilus influenzae
13. 27. Enfermedades respiratorias de causa viral de interés en salud pública. Variabilidad genética y evolución.
14. 28. Enfermedades gastrointestinales de origen viral y bacteriano.
15. 29. Enfermedades de transmisión sexual. Viruela del mono, Chlamydia trachomatis y Neisseria gonorreae
16. 30. Infecciones transmitidas por micobacterias. Mycobacterium tuberculosis
17. 31. Parásitos trasmitidos por vectores de especial relevancia: Plasmodium y Leishmania
18. 32. Enfermedades virales transmitidas por vectores: Dengue, fiebres hemorrágicas (Crimea-Congo), Zika y Chikungunya.
19. 33. VIH, hepatitis A, hepatitis B y hepatitis C
20. 34. Bases laboratoriales de la virología alimentaria. Métodos de cultivo. Métodos de identificación.
21. 35. Microorganismos de transmisión ambiental: Legionella.
22. 36. Microorganismos de transmisión alimentaria (I): Salmonella entérica y Listeria monocytogenes
23. 37. Microorganismos de transmisión alimentaria (II): Escherichia coli, Campylobacter jejuni y Campylobacter coli
24. 38. Parásitos trasmitidos por alimentos de especial relevancia: Anisakis y Trichinella
25. 39. Métodos de identificación fenotípicos y genotípicos de bacterias y virus
26. 40. Métodos de determinación de la susceptibilidad antimicrobiana.

TECNOLOGÍAS ÓMICAS Y SECUENCIACIÓN MASIVA

1. 41. Tecnologías de secuenciación masiva (NGS): fundamentos y comparación de plataformas.
2. 42. Conceptos fundamentales de genómica y secuenciación del genoma completo (WGS).
3. 43. Aplicaciones de la WGS en microbiología clínica y salud pública.
4. 44. Fundamentos, aplicaciones y limitaciones de las tecnologías de secuenciación.
5. 45. Tecnología de plataformas de secuenciación de tercera generación. Comparación con tecnologías anteriores.
6. 46. Análisis genómico de bacterias: tipificación, detección de genes de resistencia y virulencia.
7. 47. Genómica comparada y análisis del pan genoma en microorganismos.
8. 48. Estrategias para el análisis metagenómico: 16S y shotgun.
9. 49. Transcriptómica microbiana: fundamentos y aplicaciones. Análisis transcriptómico mediante RNA-seq y Single Cell RNA-seq.
10. 50. Proteómica: fundamentos y aplicaciones en microbiología. Fundamentos en detección de proteína y metabolitos.
11. 51. Integración de datos multi-ómicos en microbiología.
12. 52. Fundamentos de epigenómica y análisis de modificaciones del ADN y la cromatina.
13. 53. Aplicaciones de técnicas epigenómicas en microbiología: ChIP-seq y ATAC-seq
14. 54. Espectrometría de masas y espectrometría de infrarrojos (FTIR) aplicadas a la identificación y tipado bacteriano
15. 55. Gestión, almacenamiento e interoperabilidad de datos genómicos en sistemas sanitarios.
16. 56. Control de calidad, validación y estandarización en análisis bioinformático aplicado.

FUNDAMENTOS DE BIOINFORMÁTICA Y COMPUTACIÓN

1. 57. Introducción a la bioinformática: concepto, evolución histórica y áreas de aplicación en biomedicina
2. 58. Sistemas operativos en bioinformática: fundamentos de Linux.
3. 59. Entorno Shell y programación en Bash. Automatización de tareas.
4. 60. Gestión de archivos de texto y procesamiento de datos en entornos Unix.
5. 61. Instalación y gestión de software en entornos bioinformáticos.
6. 62. Programación en Python aplicada a bioinformática.
7. 63. Programación en R para análisis estadístico y visualización de datos.
8. 64. Bases de datos biológicas: almacenamiento, acceso y explotación.
9. 65. Acceso programático a bases de datos mediante APIs REST.
10. 66. Formatos de datos en bioinformática: FASTA, FASTQ, SAM/BAM, VCF, GFF y otros.
11. 67. Control de versiones y repositorios de código: Git y GitHub.
12. 68. Desarrollo de pipelines bioinformáticos y reproducibilidad.
13. 69. Plataformas de análisis bioinformático: Galaxy y otras herramientas.

ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE DATOS DE SECUENCIACIÓN

1. 70. Control de calidad de datos de secuenciación: fundamentos y herramientas.
2. 71. Filtrado y preprocesamiento de lecturas de secuenciación.
3. 72. Ensamblado de genomas: estrategias, algoritmos y herramientas.
4. 73. Evaluación de ensamblados genómicos.
5. 74. Alineamiento de secuencias y mapeo frente a genomas de referencia.
6. 75. Manejo y procesamiento de archivos SAM/BAM.
7. 76. Anotación genómica estructural y funcional.
8. 77. Identificación de genes de resistencia antimicrobiana y factores de virulencia.
9. 78. Análisis de plásmidos y elementos genéticos móviles.
10. 79. Tipificación genómica: MLST, cgMLST y análisis basado en SNPs.
11. 80. Filogenia molecular: fundamentos y métodos de inferencia.
12. 81. Construcción e interpretación de árboles filogenéticos.
13. 82. Análisis comparativo de genomas bacterianos.
14. 83. Análisis bioinformático de virus mediante WGS.
15. 84. Detección y análisis de variantes virales.